Positive regulation of the PhcB neighbouring regulator PrhX on expression of the type III secretion system and pathogenesis in Ralstonia solanacearum
Jiajun Huang, Rongsheng Wang, Qi Zhang, Chunli Wang, Tao Liang, Yasufumi Hikichi, Kouhei Ohnishi, Gaofei Jiang, Tao Guo, Yong Zhang
Molecular Plant Pathology 25 e13398-2024年1月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Effects of plant tissue permeability on invasion and population bottlenecks of a phytopathogen
Gaofei Jiang, Yuling Zhang, Min Chen, Josep Ramoneda, Liangliang Han, Yu Shi, Rémi Peyraud, Yikui Wang, Xiaojun Shi, Xinping Chen, Wei Ding, Alexandre Jousset, Yasufumi Hikichi, Kouhei Ohnishi, Fang Jie Zhao, Yangchun Xu, Qirong Shen, Francisco Dini-Andreote, Yong Zhang, Zhong Wei
Nature communications 15 62-2024年1月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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The transcription regulator ChpA affects the global transcriptome including quorum sensing-dependent genes in Ralstonia pseudosolanacearum strain OE1-1
Chika Takemura, Wakana Senuma, Masayuki Tsuzuki, Yuki Terazawa, Kanako Inoue, Masanao Sato, Akinori Kiba, Kouhei Ohnishi, Kenji Kai, Yasufumi Hikichi
Molecular Plant Pathology 24 1370-1384 2023年11月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Phosphatidylinositol-phospholipase C3 negatively regulates the hypersensitive response via complex signaling with MAP kinase, phytohormones, and reactive oxygen species in Nicotiana benthamiana
Shiori Takasato, Takuya Bando, Kouhei Ohnishi, Masayuki Tsuzuki, Yasufumi Hikichi, Akinori Kiba
Journal of Experimental Botany 74 4721-4735 2023年8月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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β-1,4-Cellobiohydrolase is involved in full expression of phcA, contributing to the feedback loop in quorum sensing of Ralstonia pseudosolanacearum strain OE1-1
Wakana Senuma, Masayuki Tsuzuki, Chika Takemura, Yuki Terazawa, Kanako Inoue, Akinori Kiba, Kouhei Ohnishi, Kenji Kai, Yasufumi Hikichi
Molecular Plant Pathology 24 549-559 2023年6月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Infection route in tomato roots and quorum sensing of Ralstonia pseudosolanacearum strain OE1-1
Masayuki Tsuzuki, Kanako Inoue, Akinori Kiba, Kouhei Ohnishi, Kenji Kai, Yasufumi Hikichi
Physiological and Molecular Plant Pathology 125 101995-2023年5月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Method for aseptically regenerating ginger plants and studying infection by Ralstonia solanacearum using hrp mutants
Mehbub Hasan, Akinori Kiba, Yasufumi Hikichi, Masayuki Tsuzuki, Kouhei Ohnishi
Journal of General Plant Pathology 89 185-191 2023年5月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Evaluating growth-dependent enhanced carbon dioxide sequestration potential of Azolla pinnata using cattle wastes (cow dung and cow urine)
Akshay Sarkar, Jatindra N Bhakta, Bubai Bhakta, Kouhei Ohnishi
Heliyon 9 e14610-2023年4月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Suppressed expression of ErbB3-binding protein 1 (EBP1) genes compromised the hypersensitive response cell death in Nicotiana benthamiana
Watanabe, Maho; Ohnishi, Kouhei; Hikichi, Yasufumi; Kiba, Akinori;
Plant Biotechnology 40 77-81 2023年3月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Phosphatidylinositol-phospholipase C4 suppresses the hypersensitive response of Nicotiana benthamiana
Fukui, Kotoko; Ohnishi, Kouhei; Hikichi, Yasufumi; Kiba, Akinori;
Plant Biotechnology 40 87-92 2023年3月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Complete Genome Sequences of Ralstonia solanacearum Strains Isolated from Infected Ginger Plants
Hasan, Mehbub; Satoh, Miho; Kiba, Akinori; Hikichi, Yasufumi; Ohnishi, Kouhei;
Microbiology Resource Announcements e01298-22-2023年2月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Draft Genome Sequences of Marine Bacteria, Degraders of the Sulfated Polysaccharide Ulvan, Extracted from a Green Alga, Ulva meridionalis
Bhakta, Bubai; Satoh, Miho; Ohnishi, Kouhei;
Microbiology Resource Announcements e01288-22-2023年2月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Discovery of Cyclic Lipopeptides Ralstopeptins A and B from Ralstonia solanacearum Species Complex and Analysis of Biosynthetic Gene Evolution
Matsukawa, Nao; Tsumori, Chiaki; Ohnishi, Kouhei; Kai, Kenji;
ACS Chemical Biology 18 572-582 2023年2月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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The behavior of Ralstonia pseudosolanacearum strain OE1-1 and morphological changes of cells in tomato roots
Inoue, Kanako; Takemura, Chika; Senuma, Wakana; Maeda, Hidefumi; Kai, Kenji; Kiba, Akinori; Ohnishi, Kouhei; Tsuzuki, Masayuki; Hikichi, Yasufumi;
Journal of Plant Research 136 19-31 2023年1月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Microbial Control in Greenhouses by Spraying Slightly Acidic Electrolyzed Water
Bhakta, Bubai; Yamane, Shinzo; Bhakta, Jatindra Nath; Ohnishi, Kouhei;
Horticulturae 9 81-2023年1月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Comparison of the diets of the parrotfishes Scarus ovifrons and Calotomus japonicu s using rDNA metabarcoding
Homma, Chiho; Inokuchi, Daiki; Nakamura, Yohei; Ohnishi, Kouhei; Funaki, Hiroshi; Yamaguchi, Haruo; Adachi, Masao;
Fisheries Science 88 539-553 2022年9月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Inactivation of plant pathogenic bacterium Ralstonia solanacearum in drainage solution from hydroponic system by a rotating advanced oxidation contactor equipped with TiO2/zeolite composite sheets
Nomura, Youhei; Koga, Koutaro; Ohnishi, Kouhei; Fukahori, Shuji; Fujiwara, Taku;
Journal of Water Process Engineering 48 102936-2022年8月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Assessment of arsenic sorption properties of lactic acid bacteria isolated from fecal samples for application as bioremediation tool
Bhakta, Jatindra N; Ohnishi, Kouhei; Tsunemitsu, Yuta; Ueno, Daisei; Manna, Krishnendu;
Applied Water Science 12 116-2022年6月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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A CysB regulator positively regulates cysteine synthesis, expression of type III secretion system genes, and pathogenicity in Ralstonia solanacearum
Chen, Min; Zhang, Weiqi; Han, Liangliang; Ru, Xuejuan; Cao, Yuzhu; Hikichi, Yasufumi; Ohnishi, Kouhei; Pan, Guanghui; Zhang, Yong;
Molecular Plant Pathology 23 679-692 2022年5月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Effectiveness of blocking primers and a peptide nucleic acid (PNA) clamp for 18S metabarcoding dietary analysis of herbivorous fish
Homma, Chiho; Inokuchi, Daiki; Nakamura, Yohei; Uy, Wilfredo H; Ohnishi, Kouhei; Yamaguchi, Haruo; Adachi, Masao;
PLoS One 17 e0266268-2022年4月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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A CysB regulator positively regulates cysteine synthesis, expression of type III secretion system genes, and pathogenicity in Ralstonia solanacearum
Chen, M., Zhang, W., Han, L., Ru, X., Cao, Y., Hikichi, Y., Ohnishi, K., Pan, G., Zhang, Y.
Molecular Plant Pathology 2022年2月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Phosphatidylinositol-phospholipase C1 negatively regulates the hypersensitive response in Nicotiana benthamiana
Ueta, Y., Mizutani, Y., Ohnishi, K., Hikichi, Y., Kiba, A.
Physiological and Molecular Plant Pathology 116 101724-2021年12月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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PhcQ mainly contributes to the regulation of quorum sensing-dependent genes, in which PhcR is partially involved, in Ralstonia pseudosolanacearum strain OE1-1
Takemura, C., Senuma, W., Hayashi, K., Minami, A., Terazawa, Y., Kaneoka, C., Sakata, M., Chen, M., Zhang, Y., Nobori, T., Sato, M., Kiba, A., Ohnishi, K., Tsuda, K., Kai K., Hikichi, Y.
Molecular Plant Pathology 22 1538-1552 2021年12月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Involvement of a FAD-linked oxidase RSc0454 for expression of the Type III secretion system and pathogenicity in Ralstonia solanacearum
Chen, M., Chen, N., Wang, J., Zhou, Y., Han, L., Shi, X., Hikichi, Y., Ohnishi, K., Li, J., Zhang, Y.
Molecular Plant-Microbe Interactions 34 1228-1235 2021年11月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Trigalactosyldiacylglycerol 3 protein orthologs are required for basal disease resistance in Nicotiana benthamiana
Tagami, S., Ohnishi, K., Hikichi, Y., Kiba, A.
Plant Biotechnology 38 373-378 2021年9月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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The Tn 7-based genomic integration is dependent on an attTn7 box in the glmS gene and Is site-specific with monocopy in Ralstonia solanacearum species complex
Zhang, Y., Cao, Y., Zhang, L., Hikichi, Y., Ohnishi, K., Li, J.
Molecular Plant-Microbe Interactions 34 720-725 2021年8月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Contribution of RipS type III effector family of Ralstonia solanacearum Japanese strain OE1-1 to disease development in eggplant.
Chen, L, Lei, N., Kiba, A., Hikichi, Y., Ohnishi, K.
Journal of General Plant Pathology, 87, 77-82 87 77-82 2021年1月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Genome- and mass spectrometry-guided discovery of Ralstoamides A and B from Ralstonia solanacearum species complex.
Komatsu, S., Tsumori, C., Ohnishi, K., Kai, K.
ACS Chemical Biology 15 2860-2865 2020年10月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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The putative sensor histidine kinase PhcK is required for the full expression of phcA encoding the global transcriptional regulator to drive the quorum-sensing circuit of Ralstonia solanacearum strain OE1-1.
Senuma, W., Takemura, C., Hayashi, K., Ishikawa, S., Kiba, A., Ohnishi, K., Kai, K., Hikichi, Y.
Molecular Plant Pathology 21 1591-1601 2020年10月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Silencing of phosphoinositide dependent protein kinase orthologs reduces hypersensitive cell death in Nicotiana benthamiana.
Kiba, A., Fukui, K., Mitani, M., Galis, I., Hojo, Y., Shinya, T., Ohnishi, K., Hikichi, Y.
Plant Biotechnology 37 363-367 2020年9月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Super-multiple deletion analysis of type III effectors in Ralstonia solanacearum OE1-1 for full virulence toward host plants.
4) Lei, N., Chen, L., Kiba, A., Hikichi, Y., Zhang, Y., Ohnishi, K.
Frontiers in Microbiology, 11, 1683 11 1683-2020年7月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Expression of Ralstonia solanacearum type III secretion system is dependent on a novel type 4 pili (T4P) assembly protein (TapV) but is T4P independent.
Zhang, Y., Han, L., Zhang, L., Xu, C., Shi, X., Hikichi, Y., Ohnishi, K.
Molecular Plant Pathology 21 777-793 2020年6月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Functional characterization of RsRsgA for ribosome biosynthesis and expression of the type III secretion system in Ralstonia solanacearum.
Li, J., Han, L., Chen, N., Zhu, C., Gao, Y., Shi, X., Xu, C., Hikichi, Y., Zhang, Y., Ohnishi, K.
Molecular Plant-Microbe Interactions 33 972-981 2020年6月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Phosphatidylinositol-phospholipase C2 regulates pattern-triggered immunity in Nicotiana benthamiana.
Kiba, A., Nakano, M., Hosokawa, M., Galis, I., Nakatani, H., Shinya, T., Ohnishi, K., Hikichi, Y.
Journal of Experimental Botany 71 5027-5038 2020年5月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Characterization of Glaciecola sp. enzymes involved in the late steps of degradation of sulfated polysaccharide ulvan extracted from Ulva ohnoi
Mondal, R., Ohnishi, K.
Biochemical and Biophysical Research Communications 523 441-445 2020年3月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Draft genome sequences of bacterial strains capable of degrading ulvan from the green alga Ulva ohnoi.
Mondal, R., Satoh, M., Ohnishi, K.
Front Microbiol 9 e01483-19-2020年1月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Major exopolysaccharide, EPS I, is associated with the feedback loop in the quorum sensing of Ralstonia solanacearum strain OE1-1
Hayashi, K., Senuma, W., Kai, K., Kiba, A., Ohnishi, K., Hikichi, Y.
Molecular Plant Pathology 20 1740-1747 2019年12月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Involvement of a PadR regulator PrhP on virulence of Ralstonia solanacearum by controlling detoxification of phenolic acids and type III secretion system
Zhang, Y., Zhang, W., Han, L., Li, J., Shi, X., Hikichi, Y., Ohnishi, K.
Molecular Plant Pathology 20 1477-1490 2019年11月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Specific reconstruction on pRC plasmid to facilitate its universal chromosomal integration in different Ralstonia solanacearum species complex strains
Zhang, Y., Gao, S., Li, P. Ohnishi, K.
Molecular Plant-Microbe Interactions 32 1063-1066 2019年9月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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The bacterial community in the western region of North Pacific intermediate water
Teramoto, M., Komatsu, A., Ohnishi, K
Microbiology resource announcements 8 e00757-19-2019年8月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Activation of ralfuranone/ralstonin production by plant sugars functions in the virulence of Ralstonia solanacearum
Ishikawa, Y., Murai, Y., Sakata, M., Mori, S., Matsuo, S., Senuma, W., Ohnishi, K., Hikichi, Y., Kai, K.
ACS chemical biology 14 1546-1555 2019年7月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Contribution of a lectin, LecM, to the quorum sensing signalling pathway of Ralstonia solanacearum strain OE1-1
Hayashi K, Kai K, Mori Y, Ishikawa S, Ujita Y, Ohnishi K, Kiba A, Hikichi Y.
Mol Plant Pathol 20 334-345 2019年3月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Two putative DAHP synthases of AroG1 and AroG2 and their links with type III secretion system in Ralstonia solanacearum.
Zhang W, Li J, Shi X, Hikichi Y, Zhang Y, Ohnishi K.
Front Microbiol 10 183-2019年2月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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A putative LysR-type transcriptional regulator PrhO positively regulates the type III secretion system and contributes to virulence of Ralstonia solanacearum
Zhang, Y., Li, J., Zhan,g W., Shi, H., Luo, F., Hikichi, Y., Shi, X., Ohnishi, K.
Mol Plant Pathol 19 1808-1819 2018年8月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Chloroplastic proteins are targets for the RipG effectors of Ralstonia solanacearum
Dahal, A., Chen, L., Kiba, A., Hikichi, Y., Ohnishi, K.
Int J Env Tech Sc 5 147-156 2018年5月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Involvement of avirulence genes avrA and popP1 of Japanese Ralstonia solanacearum strains in the pathogenicity to tobacco
Chen, L., Dahal, A., Zhang, Y., Rokunuzzaman, M., Kiba, A., Hikichi, Y., Ohnishi, K.
Physiol Mol Plant Pathol 102 154-162 2018年4月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Ralfuranones contribute to mushroom-type biofilm formation by Ralstonia solanacearum strain OE1-1
Mori, Y., Hosoi, Y., Ishikawa, S., Hayashi, K., Asai, Y., Ohnishi, H., Shimatani, M., Inoue, K., Ikeda, K., Nakayashiki, H., Nishimura, Y., Ohnishi, K., Kiba, A., Kai, K., Hikichi, Y.
Mol Plant Pathol 19 975-985 2018年4月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Profiling of heavy metal(loid)-resistant bacterial community structure by metagenomic-DNA fingerprinting using PCR?DGGE for monitoring and bioremediation of contaminated environment.
Bhakta, J.N., Lahiri, S., Bhuiyna, F.A., Rokunuzzaaman, M., Ohnishi, K., Iwasaki, K., Jana, B.B.
Energ Ecol Environ 3 102-109 2018年4月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Phosphoinositide 3-kinase participates in l-methionine sulfoximine-induced cell death via salicylic acid mediated signaling in Nicotiana benthamiana.
Sumida S, Ito M, Galis I, Nakatani H, Shinya T, Ohnishi K, Hikichi Y, Kiba A
J Plant Physiol 218 167-170 2017年11月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Characterization of an Alteromonas long-type ulvan lyase involved in the degradation of ulvan extracted from Ulva ohnoi.
He C, Muramatsu H, Kato SI, Ohnishi K
Biosci Biotechnol Biochem 81 2145-2151 2017年11月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Involvement of NpdA, a Putative 2-Nitropropane Dioxygenase, in the T3SS Expression and Full Virulence in Ralstonia solanacearum OE1-1.
Zhang W, Li J, Tang Y, Chen K, Shi X, Ohnishi K, Zhang Y
Front. Microbiol 8 1990-2017年10月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Efficient renaturation of inclusion body proteins denatured by SDS.
He C, Ohnishi K
Biochem Biophys Res Commun 490 (4) 1250-1253 2017年9月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Ferulic acid, but not all hydroxycinnamic acids, is a novel T3SS inducer of Ralstonia solanacearum and promotes its infection process in host plants under hydroponic condition.
Zhang Y, Li J, Zhang W, Wang R, Qiu Q, Luo F, Hikichi Y, Ohnishi K, Ding W
Front Plant Sci 8 1595-2017年9月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Long-type ulvan lyase in Alteromonas sp. is a major enzyme involved in degradation of ulvan extracted from Ulva ohnoi.
He C, Ohnishi K
Int J Env Tech Sc 4 104-109 2017年8月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Fixation of carbon dioxide by chemoautotrophic bacteria in grassland soil under dark conditions.
ang J., Kang Y., Sakurai K., Ohnishi K
Acta agr Scand B-S P 67 (4) 362-371 2017年7月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Regulation involved in colonization of intercellular spaces of host plants in Ralstonia solanacearum.
Hikichi Y, Mori Y, Ishikawa S, Hayashi K, Ohnishi K, Kiba A, Kai K
Front Plant Sci 8 967-2017年6月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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RAPD marker assisted evaluation of chloroplast DNA variation in twelve hosta taxa (Hosta Spp.).
Mehraj H., Sharma S., Ohnishi K., Shimasaki K.
Plant Omics 10 (3) 146-152 2017年5月 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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