Draft genome sequences of three Streptomyces sp. strains isolated from marine sponges in Kochi Prefecture, Japan.
Aya Hirano;Yuta Matsubara;Kaito Okamura;Tetsuya Sakurai;Dana Ulanova
Microbiology resource announcements e0147925-2026年2月13日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Identification and characterization of low-sulfur-inducible genes and pathways in roots of upland and lowland rice grown under hydroponic and soil conditions.
Kyonoshin Maruyama;Yasuhiro Tsujimoto;Miho Kishimoto;Kyouko Yoshiwara;Hiroaki Sakai;Tetsuya Sakurai;Shingo Sakamoto;Nobutaka Mitsuda;Akiko Maruyama-Nakashita
Journal of experimental botany 2026年1月9日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Genetic dissection of nonconventional introns reveals codominant noncanonical splicing code in Euglena.
Toshihisa Nomura;June-Sik Kim;Osamu Iwata;Koji Yamada;Kohei Atsuji;Yukiko Uehara-Yamaguchi;Takuhiro Yoshida;Komaki Inoue;Kotaro Takahagi;Tetsuya Sakurai;Kazuo Shinozaki;Takuro Ito;Kengo Suzuki;Keisuke Goda;Keiichi Mochida
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 122 (39) e2509937122-2025年9月30日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Short-term recovery responses in Acropora hyacinthus exposed to moderate-term thermal stress
Sam Edward N. Manalili;Dan Anthony U. Bataan;Dana Ulanova;Tetsuya Sakurai;Satoko Sekida;Shashank Keshavmurthy;Takuma Mezaki;Satoshi Kubota
Marine Biology 172 (72) 1-18 2025年4月21日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Chromosome-Scale Genome Assembly of the Freshwater Snail Semisulcospira habei from the Lake Biwa Drainage System
Osamu Miura;Atsushi Toyoda;Tetsuya Sakurai
Genome Biology and Evolution 15 (11) evad208-evad208 2023年11月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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The ability to induce heat shock transcription factor-regulated genes in response to lethal heat stress is associated with thermotolerance in tomato cultivars.
Junya Mizoi;Daisuke Todaka;Tomohiro Imatomi;Satoshi Kidokoro;Tetsuya Sakurai;Ken-Suke Kodaira;Hidehito Takayama;Kazuo Shinozaki;Kazuko Yamaguchi-Shinozaki
Frontiers in plant science 14 1269964-1269964 2023年10月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Fully sequencing the cassava full-length cDNA library reveals unannotated transcript structures and alternative splicing events in regions with a high density of single nucleotide variations, insertions?deletions, and heterozygous sequences
Akihiro Ezoe;Satoshi Iuchi;Tetsuya Sakurai;Yukie Aso;Hiroki Tokunaga;Anh Thu Vu;Yoshinori Utsumi;Satoshi Takahashi;Maho Tanaka;Junko Ishida;Manabu Ishitani;Motoaki Seki
Plant Molecular Biology 112 (1-2) 33-45 2023年5月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Draft Genome Sequence of Streptomyces sp. Strain G-5, Isolated from Marine Sponge, Kochi Prefecture, Japan
Yuta Matsubara, Tetsuya Sakurai tetsuya.sakurai@kochi-u.ac.jp, Dana Ulanova
Microbiology Resource Announcements 12 e01054-22-e01054-22 2022年12月1日 査読有り 研究論文（国際会議プロシーディングス） 共著者
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Development of Blade Cells and Rhizoid Cells Aseptically Isolated from the Multicellular Leafy Seaweed Gayralia oxysperma
Yutaro Kinoshita, Yoichi Sato, Tetsuya Sakurai, Tomohito Yamasaki, Hirofumi Yamamoto, Masanori Hiraoka
CYTOLOGIA 87 17-22 2022年3月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Draft Genome Sequence of Salinispora sp. Strain H7-4, Isolated from Deep-Sea Sediments of the Shikoku Basin
Draft Genome Sequence of Salinispora sp. Strain H7-4, Isolated from Deep-Sea Sediments of the Shikoku Basin
American Society for Microbiology 9 e00834-2020年11月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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A genome resource for green millet Setaria viridis enables discovery of agronomically valuable loci
Sujan Mamidi, Adam Healey, Pu Huang, Jane Grimwood, Jerry Jenkins, Kerrie Barry, Avinash Sreedasyam, Shengqiang Shu, John T Lovell, Maximilian Feldman, Jinxia Wu, Yunqing Yu, Cindy Chen, Jenifer Johnson, Hitoshi Sakakibara, Takatoshi Kiba, Tetsuya Sakurai, Rachel Tavares, Dmitri A Nusinow, Ivan Baxter, Jeremy Schmutz, Thomas P Brutnell, Elizabeth A Kellogg
Nature Biotechnology 38 1203-1210 2020年10月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Metabolite/phytohormone?gene regulatory networks in soybean organs under dehydration conditions revealed by integration analysis
Kyonoshin Maruyama, Kaoru Urano, Miyako Kusano, Tetsuya Sakurai, Hironori Takasaki, Miho Kishimoto, Kyouko Yoshiwara, Makoto Kobayashi, Mikiko Kojima, Hitoshi Sakakibara, Kazuki Saito, Kazuo Shinozaki
The Plant Journal 2020年2月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Localization-specific distributions of protein pI in human proteome are governed by local pH and membrane charge
Atsushi Kurotani, Alexander A Tokmakov, Ken-Ichi Sato, Vasily E Stefanov, Yutaka Yamada, Tetsuya Sakurai
BMC molecular and cell biology 2019年12月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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The Setaria viridis genome and diversity panel enables discovery of a novel domestication gene
Pu Huang, Sujan Mamidi, Adam Healey, Jane Grimwood, Jerry Jenkins, Kerrie Barry, Avinash Sreedasyam, Shengqiang Shu, Maximilian Feldman, Jinxia Wu, Yunqing Yu, Cindy Chen, Jenifer Johnson, Hitoshi Sakakibara, Takatoshi Kiba, Tetsuya Sakurai, Daniel Rokhsar, Ivan Baxter, Jeremy Schmutz, Thomas P Brutnell, Elizabeth A Kellogg
bioRxiv 2019年8月1日 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Transcriptional alterations during proliferation and lignification in Phyllostachys nigra cells
Ogita S, Nomura T, Kato Y, Uehara-Yamaguchi Y, Inoue K, Yoshida T, Sakurai T, Shinozaki K, Mochida K
Scientific Reports 2018年7月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Diurnal Transcriptome and Gene Network Represented through Sparse Modeling in Brachypodium distachyon.
Koda S, Onda Y, Matsui H, Takahagi K, Yamaguchi-Uehara Y, Shimizu M, Inoue K, Yoshida T, Sakurai T, Honda H, Eguchi S, Nishii R, Mochida K
Front Plant Sci. 8 2055-2055 2017年11月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Identification of Arabidopsis genic and non-genic promoters by paired-end sequencing of TSS tags.
Tokizawa M, Kusunoki K, Koyama H, Kurotani A, Sakurai T, Suzuki Y, Sakamoto T, Kurata T, Yamamoto YY
Plant J. 90 587-605 2017年5月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Design of an optimal promoter involved in the heat-induced transcriptional pathway in Arabidopsis, soybean, rice and maize.
Maruyama K, Ogata T, Kanamori N, Yoshiwara K, Goto S, Yamamoto YY, Tokoro Y, Noda C, Takaki Y, Urawa H, Iuchi S, Urano K, Yoshida T, Sakurai T, Kojima M, Sakakibara H, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K
Plant journal 89 671-680 2017年2月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Draft genome assembly and annotation of Glycyrrhiza uralensis, a medicinal legume.
Mochida K, Sakurai T, Seki H, Yoshida T, Takahagi K, Sawai S, Uchiyama H, Muranaka T, Saito K
Plant journal 89 181-194 2017年1月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者（筆頭）
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Alga-PrAS (Algal Protein Annotation Suite): A Database of Comprehensive Annotation in Algal Proteomes.
Kurotani A, Yamada Y, Sakurai T
Plant and Cell Physiology 58 e6-2017年1月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Efficient and Heritable Targeted Mutagenesis in Mosses Using the CRISPR/Cas9 System.
Nomura T, Sakurai T, Osakabe Y, Osakabe K, Sakakibara H
Plant and Cell Physiology 57 2600-2610 2016年12月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Analysis of single nucleotide polymorphisms based on RNA sequencing data of diverse bio-geographical accessions in barley.
Takahagi K, Uehara-Yamaguchi Y, Yoshida T, Sakurai T, Shinozaki K, Mochida K, Saisho D
Scientific Reports 6 33199-2016年9月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Cassava (Manihot esculenta) transcriptome analysis in response to infection by the fungus Colletotrichum gloeosporioides using an oligonucleotide-DNA microarray.
Utsumi, Y., Tanaka, M., Kurotani, A., Yoshida, T., Mochida, K., Matsui, A., Ishitani, M., Sraphet, S., Whankaew, S., Asvarak, T., Narangajavana, J., Triwitayakorn, K., Sakurai, T., Seki, M.
Journal of plant research 129 711-726 2016年7月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Chemical Assignment of Structural Isomers of Sulfur-Containing Metabolites in Garlic by Liquid Chromatography-Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance-Mass Spectrometry.
Nakabayashi, R., Sawada, Y., Aoyagi, M., Yamada, Y., Hirai, MY., Sakurai, T., Kamoi, T., Rowan, DD. and Saito, K.
Journal of Nutrition 146 397S-402S 2016年2月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Content of intrinsic disorder influences the outcome of cell-free protein synthesis.
Tokmakov, AA., Kurotani, A., Ikeda, M., Terazawa, Y., Shirouzu, M., Stefanov, V., Sakurai, T. and Yokoyama, S.
Scientific reports 5 14079-9 2015年9月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Transcriptome analysis of hormone-induced gene expression in Brachypodium distachyon.
Kakei, Y., Mochida, K., Sakurai, T., Yoshida, T., Shinozaki, K. and Shimada, Y.
Scientific reports 5 14476-14 2015年9月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Genome-wide analysis reveals phytohormone action during cassava storage root initiation.
Sojikul, P., Saithong, T., Kalapanulak, S., Pisuttinusart, N., Limsirichaikul, S., Tanaka, M., Utsumi, Y., Sakurai, T., Seki, M. and Narangajavana, J.
Plant molecular biology 88 531-543 2015年8月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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In Silico Analysis of Correlations between Protein Disorder and Post-Translational Modifications in Algae.
Kurotani, A. and Sakurai, T.
International journal of molecular sciences 16 19812-19835 2015年8月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Determination of growth stages and metabolic profiles in Brachypodium distachyon for comparison of developmental context with Triticeae crops.
Onda, Y., Hashimoto, K., Yoshida, T., Sakurai, T., Sawada, Y., Hira,i MY., Toyooka, K., Mochida, K. and Shinozaki, K.
Proceedings. Biological sciences / The Royal Society 282 20150964-8 2015年7月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Transcriptome analysis of thermogenic Arum concinnatum reveals the molecular components of floral scent production.
Onda, Y., Mochida, K., Yoshida, T., Sakurai, T., Seymour, RS., Umekawa, Y., Pirintsos, SA., Shinozaki, K. and Ito, K.
Scientific reports 5 8753-12 2015年3月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Whole transcriptome analysis using next-generation sequencing of sterile-cultured Eisenia andrei for immune system research.
Mikami, Y., Fukushima, A., Kuwada-Kusunose, T., Sakurai, T., Kitano, T., Komiyama, Y., Iwase, T. and Komiyama, K.
PLoS One 10 e0118587-13 2015年2月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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Plant-PrAS: A Database of Physicochemical and Structural Properties and Novel Functional Regions in Plant Proteomes.
Kurotani, A., Yamada, Y., Shinozaki, K., Kuroda, Y., and Sakurai, T.
Plant and cell physiology 56 e11-9 2015年1月1日 査読有り 研究論文（学術雑誌） 共著者
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